DICOM(Digital Imaging and Communications in Medicine)是医疗领域的一项国际标准,用于定义医学影像数据的存储、传输、共享和管理。它涉及医学图像的格式、数据交换的协议、以及相关的信息元素。DICOM标准不仅适用于医学影像(如X射线、CT、MRI等),还可以应用于医学领域的其他设备,如超声、放射治疗设备等。
在DICOM标准中,图像本身及其附带的患者信息、影像参数、设备信息等都被统一格式化,以便于不同厂商的设备和系统能够互操作。
DICOM的核心组成
1.DICOM文件结构:DICOM文件由头部信息(元数据)和图像数据两大部分组成。
- 元数据:包含关于图像的描述性信息,如患者信息、设备信息、影像拍摄的相关参数等。
- 图像数据:包含实际的医学图像信息,如CT图像的像素数据或MRI图像的采样值。
2.数据元素:DICOM文件中的每一部分信息都由 数据元素(Data Elements) 表示。数据元素有一个唯一的标识符(标签),例如PatientName(患者姓名)和PixelData(像素数据)。
DICOM文件结构
DICOM文件是一个数据集(Dataset),由多个数据元素组成,每个数据元素包括:
- 标签(Tag):标识该数据元素的唯一ID,通常是16位的十六进制数字。标签分为两个部分:Group Number(组号)和 Element Number(元素号),例如:(0x10, 0x0010) 表示患者姓名(PatientName)。
- 数据类型(VR - Value Representation):定义该数据元素的数据类型,如字符串(PN),日期(DA)等。
- 值字段(ValueField):存储实际的值,可能是字符数据、数值、图像数据等。
DICOM文件的结构可以分为:
- 文件头部(File Header):包含DICOM文件的基本信息(如文件格式、版本信息等)。
- 数据集(Dataset):包含所有的数据元素(如患者信息、图像数据等)。
- 图像数据(Pixel Data):用于存储医学图像的像素数据。
关键DICOM标签
- PixelData(标签:(0x7FE0, 0x0010)):存储图像的像素数据。
- PhotometricInterpretation(标签:(0x28, 0x0004)):描述图像的颜色空间或灰度值的解释。
- PatientName(标签:(0x10, 0x0010)):患者的姓名。
- PatientID(标签:(0x10, 0x0020)):患者的ID。
- Modality(标签:(0x08, 0x0060)):影像采集设备的类型,例如CT、MRI、X射线等。
- StudyInstanceUID(标签:(0x20, 0x000D)):唯一标识一个影像研究的标识符。
- SeriesInstanceUID(标签:(0x20, 0x005E)):唯一标识一个影像系列的标识符。
DICOM解析和处理(C#实现)
在C#中,解析和处理DICOM文件通常需要依赖第三方库,因为DICOM标准涉及的内容非常广泛。一个常用的库是 fo-dicom,它是一个开源的DICOM处理库,提供了DICOM文件的读取、解析、编辑、存储等功能。
1. fo-dicom库简介
fo-dicom是一个开源的DICOM库,适用于C#开发环境。它可以帮助开发者读取和操作DICOM文件、发送和接收DICOM数据、处理DICOM图像等。
通过fo-dicom,C#程序可以轻松解析DICOM文件,提取元数据,处理图像数据,并与DICOM服务器(如PACS)进行交互。
2. fo-dicom安装
你可以通过NuGet安装fo-dicom库:
Install-Package fo-dicom
或者使用.NET CLI:
dotnet add package fo-dicom
3. 解析DICOM文件
下面是一个使用fo-dicom解析DICOM文件并提取关键信息的示例代码:
using Dicom;
using Dicom.Imaging;
using System;
using System.IO;class Program
{static void Main(){// 读取DICOM文件string dicomFilePath = @"path_to_your_dicom_file.dcm";DicomFile dicomFile = DicomFile.Open(dicomFilePath);// 获取DICOM数据集(Dataset)DicomDataset dataset = dicomFile.Dataset;// 打印一些常见的标签信息Console.WriteLine("Patient Name: " + dataset.GetString(DicomTag.PatientName));Console.WriteLine("Patient ID: " + dataset.GetString(DicomTag.PatientID));Console.WriteLine("Study Instance UID: " + dataset.GetString(DicomTag.StudyInstanceUID));Console.WriteLine("Modality: " + dataset.GetString(DicomTag.Modality));// 获取图像数据(如果存在)if (dataset.Contains(DicomTag.PixelData)){var pixelData = dataset.Get<DicomPixelData>(DicomTag.PixelData);Console.WriteLine("Pixel data found with " + pixelData.NumberOfFrames + " frames.");}else{Console.WriteLine("No PixelData found.");}// 如果需要,显示图像var dicomImage = new DicomImage(dicomFile.Dataset);dicomImage.RenderImage().Save("output.png");}
}
4. 解释代码
DicomFile.Open(dicomFilePath):打开一个DICOM文件并返回一个DicomFile对象。
dataset.GetString(DicomTag.PatientName):从数据集中获取患者姓名。
dataset.Get(DicomTag.PixelData):获取图像数据,DicomPixelData对象包含了图像的像素信息。
DicomImage.RenderImage().Save(“output.png”):将DICOM图像渲染为PNG格式并保存到磁盘。
5. 图像数据的处理
DICOM图像数据(PixelData)是存储在DICOM文件中的原始像素数据。处理图像数据时,我们可以通过DicomPixelData类来访问这些数据,并将其渲染为常见的图像格式(如PNG、JPEG等)。
如果DICOM文件包含多个帧(例如动态CT扫描或MRI序列),DicomPixelData对象将包含多个图像帧。你可以通过以下代码来访问和操作这些帧:
var pixelData = dataset.Get<DicomPixelData>(DicomTag.PixelData);
for (int i = 0; i < pixelData.NumberOfFrames; i++)
{var frame = pixelData.GetFrame(i);// 处理单个帧// 可以将帧转换为图像、保存为文件等
}
总结
- DICOM是医学影像的标准,广泛应用于医疗图像存储、传输、共享和管理。
- DICOM文件由元数据和图像数据两部分组成。元数据包含关于患者、设备、影像等的描述性信息,而图像数据则包含医学图像的像素信息。
- C#中可以通过开源库fo-dicom来解析DICOM文件、提取元数据、处理图像数据、与PACS服务器交互等。
通过理解DICOM文件的结构和如何在C#中解析DICOM文件,你可以开发各种医学图像处理和管理应用,支持医院信息系统(HIS)、放射学信息系统(RIS)和PACS系统的集成。