简单来说分为以下几个步骤来描述整个CT系统的运行流程：

1. X射线管和探测器环绕被测物体，准直器进行高度准直X射线。
2. X射线穿过被测物料时发生衰减，其中有两个探测器，一个是参考探测器记录和测量来自X射线管的辐射强度，另一个记录穿过物体后衰减的X射线。
3. 投射的X射线和参考射线都被转换为电流信号，并由特殊的对数放大器进行放大。
4. 经过ADC数模转换模块进行转换为数字信号。
5. 数据进行预处理，其中预处理包含数据的校正（包含定位坏的探测器等）和重新格式化。
6. 阵列处理器对数据进行卷积运算。
7. 对卷积数据进行重建算法处理。
8. 对处理过的图像进行显示、存储、记录和通信。
9. 图像后处理，包含后期对图像进行窗口控制（对图像进行对比度和大小的调整等，便于识别图像）。

 

 如图所示进一步对整个系统进行了简单的描述，分成了三个大的系统。