污染物CMAQ模型的安装

CMAQ安装教程(基于intel编译器)

简介

CMAQ（Community Multiscale Air Quality）系统是由美国国家环境保护局（EPA, Environmental Protection Agency）于1998年发布，是用于估算臭氧、颗粒物、有毒化合物和酸沉降等大气污染物的模型。

CMAQ模型可与多种工具结合起来，比如区域气象模型WRF、大气污染源排放清单处理工具SMOKE等。

CMAQ的架构

安装流程

本文采用Intel编译器进行

安装环境准备

在安装基础包时，需要做好以下准备

（1）确定使用编译器的类型：GCC编译器还是intel编译器；

（2）我这里选择的intel编译器，因此需要注释掉之前的gcc编译的各类包的环境变量；

#我建议你先备份一下bashrc再修改：
cp ~/.bashrc bashrc_copy.txt）
vim ~/.bashrc
#然后注释掉不同编译器的环境变量
........

（3）CMAQ官方推荐python3.6以上的版本，因此先创建一个conda虚拟环境中，下面所有的操作都在该环境中进行；

conda create --name CMAQ_env python=3.10
conda activate CMAQ_env

（4）统一用intel编译器进行各类包的安装；

我使用的超算进行安装，可以用module，在bashrc中使用module加载intel编译器：

#查看可以使用的编译器
module avail
#使用制定编译器
module load intel/2020u4

安装依赖包

ZLIB安装

下载zlib的安装包（https://github.com/madler/zlib/releases），然后解压开始安装。

配置编译选项
CC=icc CXX=icc FC=ifort CPP='icpc -E' CPPFLAGS='-fPIC' ./configure --prefix=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/zlib_cmaq_icc_compile
编译
make
make install

zilib安装成功

添加环境变量
#打开bashrc
vi ~/.bashrc
#适用于conda环境 CMAQ 的zlib
export LD_LIBRARY_PATH=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/zlib_cmaq_icc_compile/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export PATH=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/zlib_cmaq_icc_compile/bin:$PATH

MPICH安装

下载mpich的安装包（https://github.com/pmodels/mpich/releases），然后解压开始安装。

解压：
tar -xzvf mpich-4.2.2.tar.gz -C mpich_cmaq_icc/
配置编译选项：
#3.4.2版本安装
CC=icc CXX=icc FC=ifort CPP='icpc -E' CPPFLAGS='-fPIC' ./configure --prefix=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/mpich_cmaq_icc_3.4.2_compile --with-device=ch3#或者安装4.4.2版本(我测试了两个版本，根据你自己环境选择mpich版本)
CC=icc CXX=icpc FC=ifort CPP='icpc -E' CPPFLAGS='-fPIC' CFLAGS='-std=c99 -fPIC' CXXFLAGS='-std=c++11 -fPIC' FFLAGS='-fPIC' ./configure --prefix=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/mpich_cmaq_icc_compile --with-device=ch3
  • CC=icc：
    • 设置 C 编译器为 Intel 的 icc 编译器。
  • CXX=icc：
    • 设置 C++ 编译器为 Intel 的 icc 编译器（通常是 icpc，但这里也是 icc）。
  • FC=ifort：
    • 设置 Fortran 编译器为 Intel 的 ifort 编译器。
  • CPP='icpc -E'：
    • 设置 C 预处理器为 Intel 的 icpc -E。-E 选项表示只运行预处理器，不进行编译。
  • CPPFLAGS='-fPIC'：
    • 设置预处理器标志，-fPIC 表示生成与位置无关的代码（Position Independent Code），这对于创建共享库是必需的。
  • CFLAGS='-std=c99 -fPIC'：
    • 这个选项告诉 C 编译器使用 C99 标准进行编译。C99 标准允许在 for 循环中声明变量。
  • CXXFLAGS='-std=c++11'：
    • 这个选项告诉 C++ 编译器使用 C++11 标准进行编译。C++11 提供了许多现代化的语言特性和标准库功能。
  • ./configure：
    • 运行配置脚本，准备编译环境。
  • --prefix=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/mpich_cmaq_icc_compile：
    • 指定安装路径为 /home/rain/Build_CMAQ/LIBRARIES/mpich_cmaq_icc_compile。编译安装完成后，MPICH 的所有文件将安装在这个目录下。
  • --with-device=ch3：
    • 指定使用的通信设备为 ch3，这是 MPICH 的一个通信设备模块（Channel Interface）。ch3 是 MPICH 的默认设备模块之一，支持多种网络接口。

configure的完成界面

mpich安装：
#并行make
make
#安装
make install

mpich的intel编译成功

配置环境变量：
#把bin和lib写入到bashrc中
vi ~/.bashrc
#适用于conda环境 CMAQ 的mpich
export PATH=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/mpich_cmaq_icc_compile/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/mpich_cmaq_icc_compile/lib:$LD_LIBRARY_PATH#刷新
source ~/.bashrc
设置mpigi软链接

在后续的CMAQ的安装中，如果不设置软链接，可能会报错。

cd /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/mpich_cmaq_icc_3.4.2_compile
cd lib#设置名为libmpi的软链接
ln -s libmpi.la mpigi.la
ln -s libmpi.so mpigi.so

CURL安装

下载CURL的安装包（https://github.com/curl/curl/releases），然后解压开始安装。

make
CC=icc CXX=icc FC=ifort CPP='icpc -E' CPPFLAGS='-fPIC' ./configure --prefix=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/curl_icc  --without-ssl
make
make install
配置环境变量
#适用于conda环境 CMAQ 的curl
export PATH=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/curl_icc/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/curl_icc/lib:$LD_LIBRARY_PATH
检查
which curl
curl --version

netcdf的安装

前往github下载netcdf-c（https://github.com/Unidata/netcdf-c/releases）和netcdf-fortran（https://github.com/Unidata/netcdf-fortran/releases）的安装包

安装netcdf的C语言版本
编译准备
#放入之前安装的curl软件的lib和include路径
CC=icc CXX=icc FC=ifort CPP='icpc -E' CPPFLAGS="-fPIC -I/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/curl_icc/include" LDFLAGS="-L/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/curl_icc/lib" ./configure --prefix=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/netcdf_icc_compile --disable-netcdf-4

make安装
make -j4
make install

安装netcdf的Fortran语言版本
编译准备

netcdf-fortran库是基于netcdf-c的Fortran接口库，netcdf-c的依赖库为curl，而netcdf-fortran的依赖库为netcdf-c。参数需要加上NECDF-C的路径。

export NETCDF=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/netcdf_icc_compile

./configure --prefix=$NETCDF --enable-shared

CC=icc CXX=icc FC=ifort CPP='icpc -E' CPPFLAGS="-fPIC -I/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/netcdf_icc_compile/include" LDFLAGS="-L/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/netcdf_icc_compile/lib" LD_LIBRARY_PATH="/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/netcdf_icc_compile/lib:$LD_LIBRARY_PATH" ./configure --prefix=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/netcdf_icc_compile
make安装
make -j4
make install
环境变量添加
vi ~/.bashrc#适用于conda环境 CMAQ 的netcdf
export PATH=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/netcdf_icc_compile/bin:$PATH
export NETCDF=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/netcdf_icc_compile/netcdf
export LD_LIBRARY_PATH=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/netcdf_icc_compile/lib:$LD_LIBRARY_PATH

IOAPI的安装

IOAPI (Input/Output Application Programming Interface)是一个用于CMAQ模型的输入输出的软件包，主要用于数据格式转换，将不同格式的数据(如NetCDF、二进制等)转换为CMAQ模型所需的统一数据格式。

环境准备

该包安装较为复杂，请确保之前的包（netcdf、zlib等是用intel编译的，再进行下一步）：

#解压
tar -xzvf  ioapi-3.2-2020111.tar.gz -C ioapi32
#先创建一个安装目录
mkdir /home/rain/Build_CMAQ/LIBRARIES/ioapi32_compile

然后在解压目录开始下面操作：

#写入环境变量
vim ~/.bashrc
#写入路径（根据自己的编译器决定）
export BIN=Linux2_x86_64ifortmkdir Linux2_x86_64ifort
#创建netcdf库、mpich库和zlib库的软链接
#netcdf
ln -sf /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/netcdf_icc_compile/lib/* Linux2_x86_64ifort/
#mpich
ln -sf /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/mpich_cmaq_icc_3.4.2_compile/lib/* Linux2_x86_64ifort/
Linux2_x86_64ifort/
#zlib
ln -sf /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/zlib_cmaq_icc_compile/lib/* Linux2_x86_64ifort/


cp ioapi/Makefile.nocpl ioapi/Makefile
cp m3tools/Makefile.nocpl m3tools/Makefile
cp Makefile.template Makefile
vi Makefile#在Makefile中添加下面的内容 
BIN        =Linux2_x86_64ifort
VERSION    = 3.2-${CPLMODE}
BASEDIR    = ${PWD}
INSTALL    =/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/ioapi32_compile
LIBINST =/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/ioapi32_compile/lib
BININST =/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/ioapi32_compile/binCPLMODE = nocpl
IOAPIDEFS =
PVMINCL =
NCFLIBS    = -lnetcdff -lnetcdf
IODIR      = $(BASEDIR)/ioapi
FIXDIR     = $(IODIR)/fixed_src
HTMLDIR    = $(BASEDIR)/HTML
TOOLDIR    = $(BASEDIR)/m3tools
OBJDIR     = $(BASEDIR)/$(BIN)
NCFLIBS    =-L/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/netcdf_icc_compile/lib -lnetcdf -lnetcdff


vi /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/ioapi32/ioapi/Makeinclude.Linux2_x86_64ifort AR = ar
CC = mpiicc
CXX = mpiicpc
FC = mpiifort -auto -warn notruncated_source -static-intel
OMPFLAGS = -qopenmp
OMPLIBS = -qopenmp
#ARCHLIB = -Bstaticmake configure

configure会有一些警告，不用管：

vi ioapi/Makefile
#修改路径
BASEDIR = /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/ioapi32
INSTDIR = /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/ioapi32_compile/Linux2_x86_64ifortvi m3tools/Makefile
#修改路径
BASEDIR = /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/ioapi32
INSTDIR = /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/ioapi32_compile/Linux2_x86_64ifort
安装ioapi
make all -j 4
make install

出现这个安装提示，IOAPI安装完成。

移动其他内容
#将fixed_src编译内容复制到安装目录
mkdir /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/ioapi32_compile/fixed_src/cp ioapi/fixed_src/* /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/ioapi32_compile/fixed_src/
cp /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/ioapi32_compile/fixed_src/* /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/ioapi32_compile/lib/#Linux2_x86_64ifort的软链接复制到安装目录
mkdir /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/ioapi32_compile/Linux2_x86_64ifort/
cp -rf Linux2_x86_64ifort/* /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/ioapi32_compile/Linux2_x86_64ifort/
#移动编译文件到lib或者bin
cp -rf /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/ioapi32_compile/Linux2_x86_64ifort/* /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/ioapi32_compile/bin/

自此，ioapi安装完毕，lib文件夹的内容如图所示：

CMAQ安装

环境准备

在安装完毕后，我的bashrc环境变量设置如下：

# .bashrc# Source global definitions
if [ -f /etc/bashrc ]; then. /etc/bashrc
ficd /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll# User specific aliases and functions
alias squeue='squeue -u guolf'#conda初始化，调出CMAQ的conda环境
# >>> conda initialize >>>
# !! Contents within this block are managed by 'conda init' !!
__conda_setup="$('/data/home/guolf/anaconda3/bin/conda' 'shell.bash' 'hook' 2> /dev/null)"
if [ $? -eq 0 ]; theneval "$__conda_setup"
elseif [ -f "/data/home/guolf/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh" ]; then. "/data/home/guolf/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh"elseexport PATH="/data/home/guolf/anaconda3/bin:$PATH"fi
fi
unset __conda_setup#CAMQ的环境激活
conda activate CMAQ_env#每次启动终端调用intel编译器
module load intel/2020u4# 设置库路径和编译器
export DIR=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES#用intel编译器
# 选择使用 ICC 编译器
export CC=icc
export CXX=icc
export FC=ifort
export FCFLAGS=-m64
export F77=ifort
export FFLAGS=-m64# 确保 F90 和 F90FLAGS 没有设置
unset F90
unset F90FLAGS#HDF5
export PATH=/data/home/guolf/anaconda3/bin:$PATH#ioapi
export BIN=Linux2_x86_64ifort#适用于conda环境 CMAQ 的curl
export PATH=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/curl_icc/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/curl_icc/lib:$LD_LIBRARY_PATH#适用于conda环境 CMAQ 的zlib
export LD_LIBRARY_PATH=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/zlib_cmaq_icc_compile/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export PATH=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/zlib_cmaq_icc_compile/bin:$PATH#适用于conda环境 CMAQ 的mpich
export PATH=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/mpich_cmaq_icc_3.4.2_compile/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/mpich_cmaq_icc_3.4.2_compile/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export MPICH=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/mpich_cmaq_icc_3.4.2_compile#适用于conda环境 CMAQ 的netcdf
export PATH=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/netcdf_icc_compile/bin:$PATH
export NETCDF=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/netcdf_icc_compile
export LD_LIBRARY_PATH=/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/netcdf_icc_compile/lib:$LD_LIBRARY_PATH#设置编译软件需要用到netcdf库
export CPPFLAGS=-I$NETCDF/include
export LDFLAGS=-L$NETCDF/lib

配置文件

前往网站下载CMAQ安装包（https://github.com/USEPA/CMAQ），解压：

mkdir CMAQ
tar -xzvf CMAQ-CMAQv5.3.2_12Oct2020.tar.gz -C CMAQ
mv /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/othermodel/CMAQ/CMAQ-CMAQv5.3.2_12Oct2020/* /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/othermodel/CMAQ/

为了防止后续弄错安装文件包和编译后文件，建议就在解压文件中安装，即待会设置中：CMAQ_HOME和CMAQ_REPO都为/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/othermodel/CMAQ。

cp bldit_project.csh bldit_project.csh.old
vi bldit_project.csh
#设置安装路径
set CMAQ_HOME = /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/othermodel/CMAQ
#运行bldit_project.csh
./bldit_project.csh

cp config_cmaq.csh config_cmaq.csh.oldvi config_cmaq.csh
#设置配置文件config_cmaq.csh#找到这两个参数setenv CMAQ_HOME /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/othermodel/CMAQsetenv CMAQ_REPO /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/othermodel/CMAQ#找到对应编译器的情况（intel或者gcc编译器），我这里是用的intel编译器
case intel:setenv IOAPI_INCL_DIR   /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/ioapi32_compile/bin setenv IOAPI_LIB_DIR    /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/ioapi32_compile/libsetenv NETCDF_LIB_DIR   /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/netcdf_icc_compile/lib   setenv NETCDF_INCL_DIR  /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/netcdf_icc_compile/include  setenv NETCDFF_LIB_DIR  /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/netcdf_icc_compile/libsetenv NETCDFF_INCL_DIR /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/netcdf_icc_compile/includesetenv MPI_INCL_DIR     /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/mpich_cmaq_icc_compile/includesetenv MPI_LIB_DIR      /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/mpich_cmaq_icc_compile/lib     setenv myLINK_FLAG "-qopenmp"setenv extra ""setenv mpi_lib "lmpich"

#配置环境
./config_cmaq.csh intel

运行config_cmaq.csh，不能有报错，只显示：Compiler is set to intel。

如果有报错，先解决报错。

运行成功后，才能进行下一步。

安装ICON

ICON(初始条件)是 为每种化学物质提供初始和边界条件的数据。

cd PREP/icon/scripts
./config_cmaq.csh intel
cd BLD_ICON_v532_intel &&ls *.exe

运行成功后，会有一个ICON_V532.exe程序。

安装BCON

BCON，边界条件，为每种化学物质提供边界条件的数据。

cd /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/othermodel/CMAQ
#每次安装单个程序前，都在主文件夹设置编译器为intel
./config_cmaq.csh intel
cd /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/othermodel/CMAQ/PREP/bcon/scripts
#安装BCON
./bldit_bcon.csh intel

安装MCIP

气象-化学接口处理器（MCIP）是将区域气象模型的输出数据准备为CMAQ的输入数据。

cd /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/othermodel/CMAQ
#每次安装单个程序前，都在主文件夹设置编译器为intel
./config_cmaq.csh intel
#打开mcip的文件夹
cd /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/othermodel/CMAQ/PREP/mcip/src
#编辑makefile
vi Makefile
#修改以下内容，填入netcdf的路径和IOAPI的路径
#...Intel Fortran
FC      = ifort
NETCDF = /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/netcdf_icc_compile
IOAPI_ROOT = /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/ioapi32_compile
###FFLAGS  = -g -O0 -check all -C -traceback -FR -I$(NETCDF)/include  \
###          -I$(IOAPI_ROOT)/Linux2_x86_64ifort
FFLAGS  = -FR -O3 -traceback -I$(NETCDF)/include -I$(IOAPI_ROOT)/lib
LIBS    = -L$(IOAPI_ROOT)/bin -lioapi \-L$(NETCDF)/lib -lnetcdff -lnetcdf\-qopenmp
DEFS   =

设置好之后，make生成.exe文件

make

安装CCTM

CCTM，化学传输模型，包含预测污染物浓度的主要方程，考虑多种重要过程如排放、化学反应、云和降水的吸收以及干沉降。

cd /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/othermodel/CMAQ
#每次安装单个程序前，都在主文件夹设置编译器为intel
./config_cmaq.csh intelcd /home/rain/Build_CMAQ/CMAQ_Project/CCTM/scripts#尝试安装,这次安装会报错，会生成一个BLD_CCTM开头的文件夹
./bldit_cctm.csh intel#复制文件
cp -rf /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/mpich_cmaq_icc_3.4.2_compile/include/* BLD_CCTM_v532_intel/
#再次安装
./bldit_cctm.csh intel
#检查是否成功  会生成一个BLD_CCD
ls -al BLD_CCTM_v532_intel/CCTM_*.exe

安装combin

将一组IOAPI或wrfout输入文件中的字段合并到一个输出文件中。

cd /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/othermodel/CMAQ
#每次安装单个程序前，都在主文件夹设置编译器为intel
./config_cmaq.csh intel
#进入安装文件夹
cd /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/othermodel/CMAQ/POST/combine/scripts
#安装
./bldit_combine.csh intel

自此，CMAQ安装完毕。

我遇到的报错信息总结

（1）CAMQ安装，运行：source config_cmaq.csh intel

报错：

Compiler is set to intel
ERROR: /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/othermodel/CAMQ532_compile/lib/x86_64/intel/ioapi/lib/libioapi.a does not exist in your CMAQ_LIB directorysource config_cmaq.csh intel! Check your installation before proceeding with CMAQ build.

解决办法：ioapi没有安装正确，重新安装。

(2)问题：ld: cannot find -lmpigi

运行命令： ./bldit_icon.csh intel

报错：

if ( 1 || ! -f /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/othermodel/CMAQ/UTIL/bldmake/bldmake_intel.exe ) then
cd /data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/othermodel/CMAQ/UTIL/bldmake/scripts
./bldit_bldmake.csh
rm: No match.
ld: cannot find -lmpigi***ERROR*** BLDMAKE Compile failed

解决办法：

mpigi就是libmpi，设置一个软链接，

#设置名为libmpi的软链接
ln -s libmpi.la mpigi.la
ln -s libmpi.so mpigi.so

其他信息备注

  • make install 命令主要负责将编译生成的文件复制到指定的安装目录。

  • make 命令主要负责编译源代码，生成目标文件和可执行文件。

  • CPPFLAGS变量用于指定在预处理阶段传递给编译器的选项。包括：

    1. -fPIC:
      • 该选项告诉编译器生成位置无关代码（Position-Independent Code），这是动态链接库（shared library）所需要的。
    2. -I/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/curl_icc/include:
      • 该选项告诉编译器在指定目录中查找头文件。这里指定的是curl库的头文件目录。

  • LDFLAGS变量用于指定在链接阶段传递给链接器的选项。这里指定的是curl库的库文件目录。包括：-L/data/home/guolf/guolf/CR/wrfinstalll/Build_WRF/LIBRARIES/curl_icc/lib

  • CPPFLAGS(在编译时用)

    CPPFLAGS 代表 C 预处理器标志（C PreProcessor Flags）。它用于指定 C/C++ 编译器在预处理器阶段应该使用的标志，通常包括头文件的搜索路径。

    LDFLAGS(在编译时用，而LD_LIBRARY_PATH是在运行时用)

    LDFLAGS 代表链接器标志（Linker Flags）。它用于指定链接器在链接过程中应该使用的标志，通常包括库文件的搜索路径和链接库。

  • csh和sh的环境变量不能公用；

  • CAMQ可以用intel或者GCC编译，如果同时需要WRF和CAMQ，则WRF和CMAQ的编译应该用同一种编译器。

  • CMAQ官方也提供了GCC的安装过程，详见CMAQ安装包中的DOCS文件夹：CMAQ_UG_tutorial_WRF-CMAQ_build_gcc.md

总结

本文是对CMAQ模型的安装一个简单技术流程总结。

网上也有很多CMAQ的中英文安装步骤，详见"参考"章。

每个人的环境都是不一样的，可能你还会遇到很多bug，但一步步调试总能走通的。

参考

CMAQ官方安装文档.https://github.com/USEPA/CMAQ

CMAQ官网.https://www.epa.gov/cmaq

I/O API 3.2 安装记录.https://blog.sciencenet.cn/blog-2733016-1108689.html

WRF-CMAQ | I/O API库安装编译.https://mp.weixin.qq.com/s/xqDMkCPUUpK8QxwSMBx5xQ

Intel编译器安装WRF-CMAQ.https://blog.csdn.net/weixin_55713760/article/details/120943523

CMAQ-5.3.2安装.https://mp.weixin.qq.com/s/J5vHFehlHlSvFdsrYHK04w

How To Install CMAQ V5.2 with gfortran On CentOS 7.https://www.youtube.com/watch?v=H3xWnvJtvIY&ab_channel=AtipPeethong

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