本内容旨在丰富最大熵模型的分析内容,并针对目前文章存在的问题:(1)分析内容单一,重复度高和查重率高,(2)建模流程过于简单,结果可信度评估方法过于单一等;推出以外文文献为参考依据的新课。由于教程资料刚推出,以下专题内容(专题二到专题九)目前国内中文查重率为0。因此可以作为创新点,补充拓展丰富文章内容,降低文章重复率。专题二到专题九在R平台完成。资料是实操演示,针对R语言0基础可以学习。
补充说明:物种分布建模(SDM)和生态位建模(ENM)的区别。当关注表征物种地理分布而不在时间或空间上转移模型时使用“SDM”。当强调估计物种的环境偏好,目的是寻找不同时间或空间中相似条件时,我们建议使用“ENM”。 ENM的常见应用包括表征物种的完整地理分布,估计物种入侵的地理潜力,以及预测气候变化对物种分布的可能影响(本课程专题包含内容)。
专题一:数据软件准备
- 内容介绍
- 软件安装与环境配置
- 基于R处理环境气候变量数据
专题二:(全部R平台完成) - 样点数据预处理
- 模型Ind_data(校准数据划分)
- 模型参数设置和说明
- 单组环境变量和多组环境变量同时做参数优化-kuenm(使用最新版R包-直接导出矢量图)
- 关于设备兼容性补充说明
专题三:MESS分析和MOD分析-多参数建模投影(全部R平台完成) - 利用R划定采样区并构建maxent模型(最优参数建模)
- 利用R对整个研究区投影
- 利用R对不同参数-多时期同时建模
- MESS多元环境相似度面分析(Multivariate environmental similarity surface)
- MOD最不相似变量分析(Most dissimilar variable)
- 基于R对建模结果评估(ROCs and omission rates)
专题四:模型外推风险(Extrapolation risk analysis)分析(全部R平台完成) - 参数设置和运行
- 基于MOP度量物种外推风险
- 结果解读说明(用于区域相似度分析和变化分析)
专题五:不同参数下计算模型统计数据(跨模型结果统计数据)calculation of model statistics across models (results from distinct parameter settings are allowed) - 模型3种外推模式(“E”, “EC”, “NE”)介绍
2.不同模式下外推结果说明
专题六:Projection_Changes(多时期和不同外推模式下投影区域的变化分析) - 不同时期和外推模式下的二进制文件生成
- 不同时期和外推模式下二进制文件的比较变化分析
- 不同时期和外推模式下连续性文件的比较变化分析
专题七:creation of maps showing the variance contributed per each source of variation - 建模投影区方差大小分析(不同区域可信度体现)
- 建模区方差变化分析
- 不同emi_scenarios的结果差异分析
- var_replicates的结果差异分析
专题八:制图部分(非R平台完成)
包含以上分析内容的结果制图
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