fo-dicom开源库是如何满足 DICOM标准的基本要求

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前言

前一篇文章,我们介绍了fo-dicom是一个怎样的开源库:fo-dicom,第一个基于.NET Standard 2.0 开发的DICOM开源库,在学会使用fo-dicom进行DICOM数据处理之前,需要先了解几个非常重要的概念:

DICOM基本概念

DICOM(Digital Imaging and Communications in Medicine)是数字医学图像和通信的国际标准,用于描述、传输、存储、检索、打印和显示医学图像以及相关的文本和数据信息。DICOM标准最初由美国国家电气制造商协会(NEMA)和医疗设备制造商协会(MITA)共同开发,现在已经成为全球医学图像处理和管理的标准。

DICOM标准定义了医学图像和数据在不同设备和系统之间的无缝交互性,这意味着可以在不同厂商的设备上进行图像传输和共享,同时确保图像和相关信息的完整性和准确性。#dicom#标准支持各种模态的医学图像,包括CT、MRI、X射线、超声、核医学等。

DICOM标准包括文件格式、数据元素、服务类、网络协议等多个方面,可以通过各种编程语言和软件库进行实现和应用。常见的DICOM软件库包括fo-dicom、dcmtk、GDCM、dcm4che,pydicom等。

截至目前(2024年9月),DICOM的最新版本是DICOM 3.0。DICOM标准在发布后经过不断更新和修订,以适应医学图像和通信技术的发展,并增加新的功能和改进现有功能。因此,DICOM的版本可能随着时间的推移而变化。

fo-dicom是如何满足 DICOM标准的基本要求

fo-dicom 是一个符合 DICOM 标准的 C# 实现库。它满足 DICOM 标准的基本要求,包括以下方面:

  • 支持 DICOM 数据格式:fo-dicom 支持读取、解析和生成 DICOM 数据格式,可以轻松地处理各种类型的 DICOM 文件和数据流。
  • 实现 DICOM 网络通信:fo-dicom 实现了 DICOM 网络通信协议,支持与远程 DICOM 设备进行通信,如查询、检索、存储和发送等操作。
  • 解析 DICOM 元数据:fo-dicom 可以解析 DICOM 数据集中的元数据信息,包括标识符、序列、属性值、VR(值表示)和长度等。
  • 处理 DICOM 图像数据:fo-dicom 可以处理 DICOM 图像数据,包括加载、显示和处理像素数据数组,支持多种颜色空间和位深度。
  • 支持 DICOM 安全:fo-dicom 支持 DICOM 安全机制,包括 TLS 加密和认证等功能,确保通信的安全性和可靠性。

在真正开发之前,我们先理解几个fo-dicom构建的基本概念

1、DicomElement(DICOM元素):

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在 fo-dicom 中,DicomElement(DICOM 元素)是用于表示 DICOM 数据集中的单个元素的类。每个 DICOM 元素由一个标签(Tag)、一个值(Value)和其他属性组成。

  • 标签(Tag):DICOM 标签是一个由两个 16 位数字组成的唯一标识符,用于标识 DICOM 数据集中的每个元素。标签以 “XXXX,XXXX” 的格式表示,其中 “XXXX” 是一个 16 位的十六进制数。标签可以表示数据的各种属性,例如像素值、图像位置、患者信息等。
    例如,Tag.SOPClassUID 是一个表示 SOP 类的标签。它的值是 0008,0016,表示每个 DICOM 数据集都必须包含该标签,用于指定数据集中的 SOP 类别。

  • 值(Value):DicomElement 类中的 Value 属性存储了 DICOM 元素的值。这个值可以是一个单一的值,也可以是一个多值的序列。对于多值序列,可以使用 DicomSequence 类来表示序列中的每个元素。
    例如,对于某个 DICOM 元素的值是字符串类型,可以通过 DicomElement.GetString() 方法获取字符串值。

  • VR(Value Representation,值的表示方式):VR 属性表示 DICOM 元素值的数据类型。
    例如,DicomVR.PN 表示人名(Person Name)的值表示方式。

  • VM(Value Multiplicity,值的多重性):VM 属性表示 DICOM 元素值的允许数量。
    例如,DicomVR.PN 的 VM 属性为 1,表示人名(Person Name)的值只允许有一个。

  • Length(值的长度):Length 属性表示 DICOM 元素值的字节长度。
    例如:假设有一个 DICOM 数据集中的元素为患者姓名,标签为 0010,0010,值为 “John Doe”。在 fo-dicom 中,可以通过以下方式创建和访问该元素:

DicomElement element = new DicomElement(DicomTag.PatientName, "John Doe");
string tag = element.Tag.ToString(); // "0010,0010"
string value = element.GetString(); // "John Doe"
DicomVR vr = element.ValueRepresentation; // DicomVR.PN
int vm = element.ValueMultiplicity; // 1
int length = element.Length; // 8

通过 DicomElement,我们可以方便地访问和操作 DICOM 数据集中的每个元素的标签、值和其他属性。

2、DicomDataset(DICOM数据集):

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在 fo-dicom 中,DicomDataset(DICOM 数据集)是用于表示一个完整的 DICOM 数据集的类。DICOM 数据集由多个 DICOM 元素(DicomElement)组成,每个元素都有一个唯一的标签(Tag)和对应的值(Value)。DicomDataset 提供了对 DICOM 数据集进行处理、读取和写入的功能。

DicomDataset 类具有以下特点和功能:

  • 存储 DICOM 元素:DicomDataset 可以容纳多个 DICOM 元素。通过添加、删除和修改元素,可以对 DICOM 数据集进行操作。
  • 获取和设置元素:可以通过标签获取和设置 DICOM 数据集中的元素。可以使用 DicomTag 或字符串表示的标签来访问元素。
  • 保存和加载 DICOM 数据:DicomDataset 支持将 DICOM 数据保存到文件中或从文件加载 DICOM 数据。可以使用 DicomFile 类来进行文件的读取和写入。

例如:假设有一个包含患者姓名和患者 ID 的 DICOM 数据集。我们可以使用 DicomDataset 类来创建和访问这些元素:

DicomDataset dataset = new DicomDataset();// 添加元素
dataset.Add(new DicomElement(DicomTag.PatientName, "John Doe"));
dataset.Add(new DicomElement(DicomTag.PatientID, "12345"));// 获取元素值
string patientName = dataset.GetSingleValue<string>(DicomTag.PatientName);
string patientID = dataset.GetSingleValue<string>(DicomTag.PatientID);// 修改元素值
dataset.AddOrUpdate(DicomTag.PatientName, "Jane Smith");// 删除元素
dataset.Remove(DicomTag.PatientID);

通过使用 DicomDataset,我们可以方便地创建、访问和操作 DICOM 数据集中的元素。这样的功能使得在 fo-dicom 中进行 DICOM 数据处理变得更加简单和高效。

3、DicomFile(DICOM文件):

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在 fo-dicom 中,DicomFile(DICOM 文件)是用于表示一个 DICOM 文件的类。DICOM 文件通常以 .dcm 或 .dicom 的扩展名保存,其中包含一个完整的 DICOM 数据集。DicomFile 类提供了读取和写入 DICOM 文件的功能。

DicomFile 类具有以下特点和功能:

  • 存储 DICOM 数据集:DicomFile 可以容纳一个完整的 DICOM 数据集,包括多个 DICOM 元素。
  • 读取 DICOM 文件:可以使用 DicomFile 类从磁盘中读取 DICOM 文件,并将其转换为 DicomDataset 对象。读取文件时,可以选择指定编码(Encoding)和字节顺序(ByteOrder)。
  • 写入 DICOM 文件:可以使用 DicomFile 类将 DicomDataset 对象写入到磁盘中,生成一个新的 DICOM 文件。写入文件时,可以选择指定编码(Encoding)和字节顺序(ByteOrder)。

例如:假设有一个包含患者姓名和患者 ID 的 DICOM 数据集,我们可以使用 DicomFile 类来将其保存到磁盘中:

DicomDataset dataset = new DicomDataset();
dataset.Add(new DicomElement(DicomTag.PatientName, "John Doe"));
dataset.Add(new DicomElement(DicomTag.PatientID, "12345"));// 将数据集写入到磁盘中
string filePath = "C:\\temp\\mydicomfile.dcm";
DicomFile file = new DicomFile(dataset, filePath);
file.Save();

同时,我们也可以从磁盘中读取 DICOM 文件,并将其转换为 DicomDataset 对象:

// 从磁盘中读取 DICOM 文件
DicomFile file = DicomFile.Open(filePath);// 将文件内容转换为数据集
DicomDataset dataset = file.Dataset;// 获取元素值
string patientName = dataset.GetSingleValue<string>(DicomTag.PatientName);
string patientID = dataset.GetSingleValue<string>(DicomTag.PatientID);

通过使用 DicomFile,我们可以方便地进行 DICOM 文件的读取和写入,并将文件内容转换为 DicomDataset 对象。这样的功能使得在 fo-dicom 中进行 DICOM 数据处理变得更加简单和高效。

4、DicomTag(DICOM标签):

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在 fo-dicom 中,DicomTag(DICOM 标签)是用于表示 DICOM 数据集中的元素标识符的类。每个 DICOM 元素都有一个唯一的标签,该标签指定了元素的类型、值、长度和位置等信息。

DicomTag 类具有以下特点和功能:

  • 表示 DICOM 元素标识符:DicomTag 类用于表示 DICOM 数据集中元素的标识符,包括元素的组号和元素号。
  • 获取标签属性:可以使用 DicomTag 类获取标签的属性,如组号、元素号、VR 等。
  • 访问 DICOM 元素:可以使用 DicomTag 类来访问 DICOM 数据集中具有特定标签的元素。

例如:假设有一个包含患者姓名和患者 ID 的 DICOM 数据集。我们可以使用 DicomTag 类来创建和访问这些元素:

// 创建标签
DicomTag patientNameTag = new DicomTag(0x0010, 0x0010);
DicomTag patientIDTag = new DicomTag(0x0010, 0x0020);// 获取标签属性
int groupNumber = patientNameTag.Group;
int elementNumber = patientNameTag.Element;
string vr = patientNameTag.VR.Code;// 访问 DICOM 元素
DicomDataset dataset = new DicomDataset();
dataset.Add(new DicomElement(patientNameTag, "John Doe"));
dataset.Add(new DicomElement(patientIDTag, "12345"));string patientName = dataset.GetSingleValue<string>(patientNameTag);
string patientID = dataset.GetSingleValue<string>(patientIDTag);

通过使用 DicomTag,我们可以方便地创建、访问和操作 DICOM 数据集中的元素标识符。这样的功能使得在 fo-dicom 中进行 DICOM 数据处理变得更加简单和高效。

特别需要注意的是:每个新版本的 DICOM 标准发布时,都可能会有新的 DICOM 标签的增加或旧标签的删除。DICOM 标准不断发展和演变,以适应医疗领域的需求和技术进步。DICOM 标准由国际电工委员会(IEC)和国际标准化组织(ISO)共同制定和管理,经过广泛的行业参与和专家审查。每个新版本的 DICOM 标准都会根据医疗实践的需求和技术的发展进行更新和扩展。新版本的 DICOM 标准通常会引入新的标签,以支持新的图像、测量、功能等。这些新标签可以用于描述新的医疗设备、新的图像处理算法或新的数据需求。

同时,旧版本的 DICOM 标签也可能会被删除或废弃。一些标签在新版本中可能不再使用,因为它们已经过时或不再符合当前的医疗实践。这样的修改可以确保 DICOM 标准的准确性、一致性和适应性。

因此,了解和跟踪最新的 DICOM 标准版本对于正确解释和处理 DICOM 数据集非常重要。开发人员和用户需要及时了解最新版本的 DICOM 标准,并确保使用的库或工具能够支持该版本以获取最佳的兼容性和功能。

5、DicomServiceClass(DICOM服务类):

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在 fo-dicom 中,DicomService(DICOM 服务)是一个抽象类,用于表示与 DICOM 网络通信相关的服务。它提供了一组方法和属性,用于建立 DICOM 连接、执行 DICOM 操作以及处理 DICOM 数据。

DicomService 包括以下基本概念:

  • 连接:DicomService 提供了建立和管理 DICOM 连接的功能。它可以作为一个服务端监听传入的连接请求,也可以作为一个客户端发起连接到远程服务器。
  • 操作:DicomService 定义了执行各种 DICOM 操作的方法。这些操作包括查询、检索、存储、发送等。使用这些方法,可以向远程 DICOM 设备发送请求,并接收和处理响应。
  • 事件:DicomService 提供了一组事件,用于捕获和处理与 DICOM 通信相关的事件。例如,可以通过处理 OnConnectionClosed 事件来处理连接关闭的情况,或者通过处理 OnCStoreRequest 事件来处理存储请求。

例如:以 DicomServer 类为例,它是 fo-dicom 中用于实现 DICOM 服务端的具体类。以下是一个示例代码:

// 创建 DICOM 服务端实例
DicomServer server = new DicomServer();// 设置服务端的参数和配置
server.AETitle = "MY_AE_TITLE";
server.Port = 11112;// 处理连接建立的事件
server.OnConnectionRequest += (sender, e) =>
{Console.WriteLine("收到连接请求:" + e.Association.CallingAETitle);// 接受连接请求e.AcceptAssociation();
};// 处理存储请求的事件
server.OnCStoreRequest += (sender, e) =>
{Console.WriteLine("收到存储请求:" + e.File.Dataset.GetSingleValueOrDefault<string>(DicomTag.PatientName, ""));// 存储请求处理逻辑...// 发送存储响应e.SendResponse(DicomStatus.Success);
};// 启动服务端并开始监听连接
server.Start();Console.WriteLine("DICOM 服务端已启动,监听端口:" + server.Port);// 等待用户按下任意键停止服务端
Console.ReadKey();// 停止服务端
server.Stop();Console.WriteLine("DICOM 服务端已停止。");

在上述示例中,我们创建了一个 DicomServer 实例,并设置了服务端的参数,如 AE 标题和监听端口。然后,我们通过订阅 OnConnectionRequest 事件来处理传入的连接请求,当收到连接请求时,打印相应的消息并接受该连接。同时,我们还订阅了 OnCStoreRequest 事件来处理存储请求,在收到存储请求时,打印患者姓名并发送存储响应。最后,我们启动服务端并开始监听连接。

通过使用 DicomService 的具体实现,如 DicomServer,我们可以方便地实现自定义的 DICOM 服务端或客户端,并处理与 DICOM 通信相关的各种操作和事件。这使得在 fo-dicom 中进行 DICOM 网络通信变得更加灵活和可定制。

这一块是DICOM通信部分非常重要的内容。后续我会重点分析这个部分的内容,期待分享。

6、DicomImage(DICOM图像):

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在 fo-dicom 中,DicomImage(DICOM 图像)是一个用于表示 DICOM 图像数据的类。它提供了一组方法和属性,用于加载、显示和处理 DICOM 图像。

DicomImage 包括以下基本概念:

  • 数据集:DicomImage 是基于一个 DICOM 数据集构建的。该数据集通常包含有关图像的元数据信息,如像素数据大小、采样率、颜色空间等。使用 DicomFile 或 DicomDataset 类可以从 DICOM 文件或数据流中读取数据集。
  • 像素数据:DicomImage 还包含一个或多个像素数据数组,这些数组存储了图像的像素值。使用 GetPixelData 方法可以获取像素数据数组。根据图像的颜色空间和位深度,可以使用不同的像素数据类型来表示像素值。
  • 显示:DicomImage 提供了一组方法和属性,用于在图像视图中显示图像。可以使用 WPF 或 WinForms 控件来实现具体的图像显示。

例如:以 DicomImage 类为例,以下是一个示例代码:

// 从 DICOM 文件中加载图像数据集
DicomFile dicomFile = DicomFile.Open("image.dcm");
DicomImage dicomImage = new DicomImage(dicomFile.Dataset);// 获取图像的像素数据数组
ushort[] pixelData = dicomImage.GetPixelData<ushort>();// 显示图像
WpfImageViewer imageViewer = new WpfImageViewer();
imageViewer.Image = dicomImage.RenderImage();
imageViewer.Show();

在上述示例中,我们首先使用 DicomFile 类从 DICOM 文件中读取图像数据集,然后创建一个 DicomImage 实例,并将数据集作为参数传递。接下来,我们使用 GetPixelData 方法获取像素数据数组,并将其存储到 pixelData 变量中。最后,我们使用 WpfImageViewer 控件显示图像。

通过使用 DicomImage 类,我们可以轻松地加载、显示和处理 DICOM 图像数据。这使得在 fo-dicom 中进行 DICOM 图像处理变得更加方便和高效。

总结

上面介绍的这些基本概念,只是众多内容中的一小部分,仅仅因为这些概念在使用fo-dicom期间经常被引用,理解它们的含义和使用方法对于成功处理DICOM数据非常重要。

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